農業補貼是一國政府對本國農業支援與保護政策體系中最主要、最常用的政策工具，是政府對農業生產、流通和貿易進行的轉移支付。WTO框架下的農業補貼是指標對於國內農業生產及農產品的綜合支援。
WTO農業多邊協議框架下，農業補貼具有兩層含義：
一種是廣義補貼，即政府對農業部門的所有投資或支援，其中較大部分如對科技、水利、環保等方面投資，由於不會對產出結構和農產品市場發生直接顯著的扭曲性作用，一般被稱為“綠箱”政策。 “綠箱”政策措施主要包括：
①一般農業服務，如農業科研、病蟲害控制、培訓、推廣和諮詢服務、檢驗服務、農產品市場促銷服務、農業基礎設施建設等;
②糧食安全儲備補貼;
③糧食援助補貼;
④與生產不掛鉤的收入補貼;
⑤收入保險計劃;
⑥自然災害救濟補貼;
⑦農業生產者退休或轉業補貼;⑧農業資源儲備補貼;⑨農業結構調整投資補貼;⑩農業環境保護補貼;地區援助補貼。
二對糧食等農產品提供的價格、出口或其他形式補貼，這類補貼又稱為保護性補貼，通常會對產出結構和農產品市場造成直接明顯的扭曲性影響，一般被稱為“黃箱”政策。主要包括政府對農產品的直接價格干預和補貼，種子、肥料、灌溉等農業投入品補貼、農產品營銷貸款補貼、休耕補貼等。WTO《農業協定》的“黃箱”政策中規定給予發展中國家特殊差別待遇，對發展中國家為促進農業和農村發展所採取的下述支援和補貼措施可免予削減承諾，簡稱“發展箱”。主要包括：
①農業投資補貼;
②對低收入或資源貧乏地區生產者提供的農業投入品補貼;
③為鼓勵生產者不生產違禁麻醉作物而提供的支援