参考文献序号在引文标注中的位置比较复杂，应区别情况做不同处理。大致有如下几种情形。
①文献[1]指出;文献[2]认为……。———这是最简单的情况，即“[l]”“[2]”作为语句的组成部分(能读出来)，只有紧跟着“文献”2字并不排成上角标这一种形式。
②王xx指出，……[3];张xx认为……[4]。———“[3]”“[4]”放在句末点号〔这里分别是分号和句号)之前。也可排为王xx[3]指出，;张xx[4]认为……。这2种形式可取其一。
③陈x“x认为”，……。……。[5]笔者认为。———陈 x“x认为”的内容包含了 2 个句子。“[5]”(上角标)应放在最后一个句号之后，表示这2个句子都是文献[5]中的引文。在这种情况下，不能采取如下的形式。陈xx[5]认为：……。笔者认为……。若如此就会有歧义，即第2个句子是不是陈xx认为的内容还要读者去分辨。此外，这里，若“认为”后不是冒号而是逗号，那么，“认为”的内容只能是在第 1 个句号之前。
顺便指出，“认为”“指出”之后的内容如果是原文原话，就应当加引号;而引用的仅是原文献的意思，则不加引号，如以上各例。